Ali Qassem a étudié la pharmacie et la chimie pharmaceutique à l'université de Tishreen en Syrie. Il a obtenu une bourse d'excellence de l'université de Milan, en Italie, pour préparer un master en biotechnologie pharmaceutique. Dans le cadre de son mémoire de master, il a travaillé sur la mise au point d'une méthode analytique pour mesurer l'activité de l'enzyme 3-HAO ex vivo et in vitro. Ali a été sélectionné pour le programme européen de formation doctorale "NanoReMedi" sous la supervision des Professeurs Gilles Subra et Alexander Bittner et de la Dr. Cécile Echalier. Sa thèse de doctorat porte sur la synthèse de nanomatériaux à partir de peptides hybrides auto-assemblés et d'autres biomolécules en vue de leur utilisation dans des traitements de médecine régénérative.