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Une stratégie “toute basique” de synthèse d’ARN mise au point à l’IBMM commercialisée par la société ChemGenes Corporation

Une approche totalement innovante réalisée au sein de l’équipe “Oligonucléotides Modifiés” dirigée par Jean-Jacques Vasseur

par corneille - publié le

Une stratégie “toute basique” de synthèse d'ARN mise au point à l'IBMM commercialisée par la société ChemGenes Corporation

Comparativement à la synthèse d’ADN, la production d’ARN est beaucoup plus complexe. Le point délicat résulte de l’instabilité de l’ARN en milieu basique due à l’attaque de l’hydroxyle-2’ des ribonucléotides sur l’atome de phosphore internucléosidique adjacent. De ce fait, la plupart des protections conventionnelles utilisées pour cet hydroxyle-2’ sont fluoro-labiles (TBDMS par ex.). Cette déprotection est délicate et requiert notamment des étapes de dessalages et purifications contraignantes.

Françoise Debart, DR2 CNRS à l’IBMM a développé au sein de l’équipe “Oligonucléotides Modifiés” dirigée par Jean-Jacques Vasseur une approche totalement innovante rendant la synthèse d’ARN aussi simple que la synthèse d’ADN. Cette approche est “révolutionnaire” dans le sens où elle est basée sur l’utilisation de protections baso-labiles acyloxymethyl. Ainsi, en fin d’élongation de l’ARN sur support solide, celui-ci est entièrement déprotégé et coupé du support par un traitement entièrement basique qui ne dégrade pas l’ARN et n’impose pas d’étape supplémentaire de purification par rapport à une synthèse d’ADN.

Ce procédé breveté (FR 08 02928 étendu à l’International WO 2009/144418 A) a fait l’objet en début d’année d’un accord de licence non-exclusive (L10213) entre le CNRS, l’Université de Montpellier et la société ChemGenes Corporation. Cette compagnie américaine vient de proposer dans son nouveau catalogue les unités de construction phosphoramidites 2’-O-Pivom nécessaires à la synthèse de ces ARNs.
Bibliographie :
“A Base-Labile Group for 2’-OH Protection of Ribonucleosides : A Major Challenge for RNA Synthesis”, T. LAVERGNE, J.-R. BERTRAND, J.-J. VASSEUR and F. DEBART, Chemistry : A European Journal, 14, 9135-9138 (2008)
“Chemical RNA Synthesis Method”, F. DEBART, J.-J. VASSEUR, T. LAVERGNE, PCT : WO 2009/144418 A1.